吉林大學藥學院坐落于吉林大學新民校區，教學實驗大樓建筑面積8000平方米。學院始建于1998年，前身為原白求恩醫科大學藥學院，由著名的天然藥物化學家徐景達教授等一批著名的科學家和教育學家積極倡導并參與創辦的，同年開始招收藥學專業本科生。2000年6月，吉林大學、吉林工業大學、白求恩醫科大學、長春科技大學、長春郵電學院等五校合并，更名為吉林大學藥學院。次年6月，原白求恩醫科大學生物醫學工程（再生醫學）本科專業并入藥學院，2013年，增設臨床藥學系，開設臨床藥學專業。學院下設4個學系， 4個本科生實驗教學中心，4個國家中醫藥管理局重點實驗室，1個教育部重點實驗室，7個吉林省重點實驗室（工程中心）以及3個校企聯合實驗室。設有藥學、臨床藥學、生物醫學工程（再生醫學）3個本科專業， 4個博士學位授權點,5個碩士學位授權點，1個博士后流動站,另設藥學專業碩士授權學科點。